Колледж Шарце включает одиннадцать отделений: Докханг (rDo-khang Khang-tshan), Пхукханг (Phu-khang Khang-tshan), Ньяг Ре (Nyag-re Khang-tshan), Лхопа (Lho-pa Khang-tshan), Зунгчу (Zung-chu Khang-tshan), Тхепо (The-po Khang-tshan), Чони (Co-ni Khang-tshan), Та Он (rTa-'on Khang-tshan, rTa-dbon Khang-tshan), Нгари (mNga'-ris Khang-tshan), Согпа (Sog-pa Khang-tshan) и Гунгру (Gung-ru Khang-tshan) кхангцены.

Образовательные программы обоих колледжей Гандена – Джангце и Шарце – сочетают изучение и сутры, и тантры. В этом они отличаются от двух других главных гелугпинских монастырей в районе Лхасы – Сера (Se-ra dGon-pa) и Дрепунга. Из четырёх колледжей Дрепунга в колледжах Лосел Линг (Blo-gsal gling Grva-tshang) и Гоманг (sGo-mang Grva-tshang) изучают только сутру, в колледже Нгагпа (sNgags-pa Grva-tshang) – только тантру, а в колледже Деянг (bDe-dbyangs Grva-tshang) – и то, и другое. Из трёх колледжей Сера в колледжах Дже (Byes Grva-tshang) и Ме (sMad Gvra-tshang) изучают только сутру, а в колледже Нгагпа (sNgags-pa Grva-tshang) – только тантру. В Индии колледжи Дрепунг Нгагпа и Сера Нгагпа добавили в свои программы изучение сутры. Колледж Дрепунг Деянг не был восстановлен.

Колледж Джангце, так же как колледжи Сера Дже и Сера Нгагпа, следует учебникам сутры (yig-cha) Джецунпы Чокьи Гьелцена (rJe-btsun-pa Chos-kyi rgyal-mtshan) (1469–1544). В колледже Шарце, так же как в Дрепунг Лосел Линге и в тантрическом колледже Дрепунг Нгагпа, используют учебники Пятнадцатого Ганден трипы Панчена Сонама Драгпы (Pan-chen bSod-nams grags-pa) (1478–1554). Что касается других колледжей трёх главных гелугпинских монастырей в районе Лхасы (gdan-sa gsum), то в колледже Сера Ме принят учебник сутры Кхедруба Тендарвы (mKhas-grub dGe-'dun bstan-pa dar-rgyas) (1493–1568), а колледжи Дрепунг Гоманг и Дрепунг Деянг используют учебники, написанные Первым Кункхьеном Джамьянгом Шепой Нгавангом Цондру (Kun-mkhyen 'Jam-dbyangs bzhad-pa Ngag-dbang brtson-'grus) (1648–1721). Все колледжи следуют текстам Цонкапы, Гьелцаба Дже и Кхедруба Дже, а их учебники отличаются лишь тонкостями толкования.

В обучение входит заучивание, логический анализ и дебаты. В течение трёх лет монахи изучают подготовительные предметы – логику. Основная часть обучения включает пять главных текстов и длится одиннадцать последующих лет. В конце каждого года монахи должны сдавать экзамены (rgyugs-sprod), чтобы перейти на следующий курс. Тот, кто по истечении этих одиннадцати лет завершил изучение сутры и прошёл через формальные дебаты перед смешанным собранием всех монахов колледжа (gling-bsre dam-bca'), получает степень геше-цогрампы (dGe-bshes Tshogs-ram-pa). Тот, кто продолжает обучение следующие пять лет, а потом во время большого молитвенного фестиваля в Лхасе, в храме Джокханг выдерживает формальные дебаты перед общим собранием монахов трёх главных гелугпинских монастырей, расположенных в районе Лхасы, получает звание геше-лхарампы (dGe-bshes Lha-ram-pa). Монахи, которые просто сдают экзамены по заучиванию главных текстов, но не завершают обучение на звание геше, получают степень кьеримпы (bsKyed-rim-pa).

Геше-цогрампы и геше-лхарампы должны пройти тантрическое обучение или в Нижнем тантрическом колледже Гьюме (rGyud-smad Grva-tshang), или в Верхнем тантрическом колледже Гьюто (rGyud-stod Grva-tshang). В какой из этих колледжей они отправятся, зависит от места, где они родились. По завершении изучения тантры, которое также основано на дебатах, и участия в формальных дебатах по тантре, они получают степень геше-нгагрампы (dGe bshes sNgags-ram-pa). Геше могут либо остаться в тантрическом колледже, либо вернуться в Ганден. Если они возвращаются, им необходимо принять участие в других формальных дебатах по тантре в своём родном колледже.

[См.: Краткая история Гьюме и Гьюто, Нижнего и Верхнего тантрических колледжей.]

Монахи, которые получили степень кьеримпы, могут изучать тантру в своём колледже. В колледже Джангце они придерживаются учебников Гьюме, составленных Гью Шерабом Сенге (rGyud Shes-rab seng-ge) (1383–1445), а в Шарце используют учебники Гьюто, написанные Гьюченом Кунга Дондрубом (rGyud-chen Kun-dga' don-grub) (1419–1486). Тот, кто проходит через формальные дебаты по тантре в Джангце, также получает степень геше-нгагрампы, а в Шарце – степень ума-шеринги (dBu-ma bshad-ring).

[См.: Обзор монастырской образовательной системы в традиции гелуг.]

Колледж Джангце отвечает за ежегодное проведение полных ритуалов Акшобхьи (Mi-bskyod-pa) – формы Гухьясамаджи (gSang-ba 'dus-pa), в то время как Шарце – за обряды, посвящённые тринадцати парам божеств Ваджрабхайравы (rDo-rje 'Jigs-byed Lha bcu-gsum). Кроме того, каждое отделение этих колледжей ответственно за ежегодное совершение полных ритуалов определённого тантрического божества из четырёх классов тантры. В Ганден Джангце за обряды, посвящённые божествам из класса ануттарайога-тантры (rnal-'byor bla-med rgyud) отвечают: Пхара, Конгпо и Драньи за ритуалы Акшобхьи Гухьясамаджи; Хардонг – за ритуалы Махачакры Ваджрапани (Phyag-rdor 'Khor-chen). Лубум и Цхава поддерживают ритуалы Ваджрадхату (rDor-dbyings) из йога-тантры (rnal-byor rgyud). Серконг, Дора и Самло – Вайрочаны Абхисамбодхи (rNam-snang mngon-byang) из класса чарья-тантры (spyod-rgyud, тантры поведения). В крийя-тантре (bya-rgyud, тантра действия) обрядами Акшобхьи (Mi-'khrugs-pa) занимаются отделения Гово, Трехор и Гьелронг.

В Гандене Шарце за ритуалы класса ануттарайога-тантры отвечают: Докханг, Та Он и Гунгру, которые выполняют практики тринадцати пар божеств Ваджрабхайравы; Тхепо и Лхопа, практикующие Чакрасамвару (bDe-mchog) линии передачи Луипы (Lu'i-pa), и Ньяг Ре – проводящие ритуалы Калачакры (Dus-'khor). Чони и Согпа поддерживают ритуалы Самвида (Kun-rig) класса йога-тантры. Что касается крийя-тантры, Зунгчу проводит ритуалы девяти божественных форм Амитаюса (Tshe-dpag-med lha-dgu), Нгари – практику восьми сугат Бхайшаджи (Будды Медицины) (sMan-lha bDe-gshegs-brgyad), а Пхукханг – обряды шестнадцати архатов (gNas-brtan phyag-spyod).

Чогьял (Chos-rgyal, Дхармараджа) является особым защитником (srung-ma) зала общих собраний всего монастыря Гандена (dGa'-ldan Bla-spyi), а Палден Лхамо (dPal-ldan Lha-mo) – особая защитница Гандена Джангце. Ежедневно монахи Джангце проводят ритуалы этой защитницы на благо Его Святейшества Далай-ламы и тибетского правительства, а по отдельным поводам эти ритуалы совершаются в развёрнутом виде. Особыми защитниками Его Святейшества Далай-ламы являются Палден Лхамо и Нечунг (gNas-chung), а тибетского правительства – Палден Лхамо и Джамсинг ('Jam-sing). Так как Палден Лхамо чёрного цвета, а Нечунг и Джамсинг красные, то обе пары называют чёрно-красными парами (dMar-nag gnyis). Особый защитник Гандена Шарце – Сетраб (Se-khrab).