5 апреля — по его инициативе впервые отмечается День русской нации в годовщину победы Александра Невского на Чудском озере.

6 мая — первая акция прямого действия НБП — захват крейсера «Аврора» в Петербурге.

1997 — участие в довыборах в Государственную думу по Георгиевскому избирательному округу Ставропольского края.

1998, 1 октября — первый съезд НБП. После съезда поданы документы на регистрацию партии в Министерство юстиции, получен отказ.

Ноябрь — второй съезд НБП.

Создает Фронт трудового народа, армии и молодежи совместно с В. Анпиловым и С. Тереховым.

1999 — выдвигает проект «Вторая Россия» по отделению от стран бывшего СССР (Украина, Казахстан, Латвия) территорий, населенных русскими, и созданию там самостоятельного государства.

2001, 6 апреля — арестован ФСБ на хуторе Пирогова на Алтае совместно с соратниками. Этапирован в Москву в следственный изолятор ФСБ «Лефортово». Предъявлено обвинение в незаконном хранении оружия, создании незаконных вооруженных формирований, покушении на территориальную целостность Республики Казахстан и в терроризме.

2002 — находясь в тюрьме, выдвинут кандидатом на довыборах в Государственную думу по Нижегородской области.

2003, 15 апреля — осужден судьей Саратовского областного суда Владимиром Матросовым на четыре года лишения свободы. Большинство обвинений снято.

30 июня — освобожден условно-досрочно из колонии в городе Энгельс.

2004, 2 августа — акция НБП по захвату кабинета главы Минздравсоцразвития М. Зурабова в знак протеста против монетизации льгот. Участники получают от двух до четырех лет лишения свободы.

16 декабря — акция по захвату приемной администрации президента с требованием изменения государственной политики. Арестованы 39 участников, приговорены к различным срокам лишения свободы.

2005 — женится на актрисе Екатерине Волковой.

2006, 11–12 июля — создание коалиции «Другая Россия» совместно с Г. Каспаровым, М. Касьяновым и рядом других общественных деятелей.

7 ноября — рождение сына Богдана.

16 декабря — первый Марш несогласных в Москве на Триумфальной площади.

2007, 3 марта — несанкционированный массовый Марш несогласных в Санкт-Петербурге по Невскому проспекту. Лимонов в самом начале марша задержан полицией.

19 апреля — Московский городской суд принимает решение о запрете Национал-большевистской партии как экстремистской организации.

Июнь—сентябрь — праймериз коалиции «Другая Россия» по выдвижению единого кандидата в президенты. Лимонов сперва поддерживает М. Касьянова, после выхода последнего из коалиции — Г. Каспарова. Документы для выдвижения кандидатом Г. Каспаров не подал.

2008, 17 июля — рождение дочери Александры.

2009, 31 января — проходит первый митинг в защиту свободы собраний на Триумфальной площади в рамках выдвинутой Лимоновым «Стратегии-31». Акции проходят каждое 31-е число, заявителями наряду с Лимоновым становятся Л. Алексеева и К. Косякин. Вплоть до середины 2014 года митинги разгонялись полицией, Лимонов неоднократно задерживался.

2010, 10 июля — учредительный съезд партии «Другая Россия».

2011, 10 декабря — призывает протестующих против фальсификации выборов в Государственную думу вместо выхода на Болотную площадь пойти на митинг на площади Революции и затем — к Центральной избирательной комиссии. После отказа большинства лидеров протестов резко критикует их. Несмотря на уход большей части митингующих на Болотную площадь, проводит акцию «300 спартанцев» на площади Революции.

2012, сентябрь — на втором съезде «Другой России» принята концепция двух врагов — власти и буржуазной либеральной оппозиции.

2013, сентябрь — на третьем съезде «Другой России» выдвигает лозунг «Отобрать и поделить» как призыв к пересмотру итогов приватизации.

2014, март — поддерживает присоединение Крыма к России.

30 апреля — четвертый съезд «Другой России» высказывается за продолжение «Русской весны» на Украине.

Май — начинаются отправка «Другой Россией» добровольцев и сбор помощи для ополчения Донбасса, создается движение «Интербригады».